洪金元（？—？），本籍福州闽县，清朝官员。
洪金元于道光三十年（1850年）上任淡水厅大甲中军守备，为台湾清治时期的地方官员，该官职主要从事大甲地区武职事务，品等不高，只为正七品以下，洪金元日后于咸丰十一年又再度回任斯职。
